宗藩大会的落幕并不意味着整个宗室问题就立即得到完美的解决。
其中最重要的是，要解决世袭罔替亲王的问题。皇室必须有宗室屏藩，作为平衡勋贵、文官之外的第三股势力。此前的历代皇帝因为靖难之乱的心理阴影，将宗室完全排除在政治生活之外，实际上造成了皇权的自限。
如今，朱翊钧通过让宗室开办工厂、分配殖民地矿藏的方式，让他们在经济上不完全依赖宗禄；同时，开放宗室科举之禁，让他们能够进入中下层行政管理体系；最后，还需要确定世袭罔替的亲王，来确定将来“保皇党”的核心力量。
因为李太后的原因，潞王这个世袭罔替在所有人的预料之中；周王因为在宗藩问题上全力支持皇帝，初代周王作为成祖的同母弟弟，也获得了世袭罔替的尊荣；郑王尽管在宗室里面算是小宗，但郑王世子是格物院首任院长，郑王本人被任命宗人府宗正，这个世袭罔替谁也挑不出理来。
除了上述三家之外，其余大宗对世袭罔替也都眼热的很。这时候去年听了郑王世子传出来的话，削减自家田地的几位王爷有福了——他们将自家土地或卖或送，最后保留的土地都在两万亩以内，而朱皇帝必须对支持自己政策的宗室给予表彰。
于是，去年差点被家人骂成傻子的靖江王、晋王、鲁王、秦王、蜀王被皇帝册封为世袭罔替亲王——也让其他二十多位无动于衷的亲王差点把肠子悔青了。
在私下的聚会中，他们不敢骂皇帝，但大肆攻击这些“舔沟子”的亲王却免不了——殊不知晋王、鲁王、秦王三位亲王并没有这么高的觉悟，而是被皇帝派出内臣悄悄做了警告。只有蜀王和靖江王两位是主动减地的，因此在册封仪式上，又被赏赐了白表黄里大带——其余亲王用的是白表红里大带。
用自家数万亩的土地换了一个世袭罔替的王爵，晋、鲁、秦三位亲王虽然是喜出望外，但也肉疼的很。然而随后朝廷颁发的《爵位册封条令》，则让他们扶额称庆。
万历六年六月十六，朝廷颁发了《爵位册封条令》，将已经改的七零八落的宗藩制度用法律的形式加以固定。
条令中首先明确了宗室和勋贵的政治地位。具体如下：亲王分为世袭罔替和亲王两种；郡王分三级，而且起名简单粗暴：一等郡王、二等郡王、三等郡王。
然后宗室将进入公候伯子男的勋贵序列，和非宗室走同样的降袭路子。起名同郡王，例如公爵直接一等公、二等公、三等公，以此类推。
宗室降到三等男爵的时候，不管往下传多少代，不再降等。候爵以下，解除与勋贵联姻的禁令；伯爵以上，得朝廷议政权；三等男爵以上，得地方议政权；为此，朝廷将设议政院，议政院成员可对朝廷和地方政策提出建议和意见。
其次条令规定了降袭的规则：每代宗室或勋贵，嫡长子可降袭一等承爵；家主可另选一子降二等袭爵；其余诸子平头百姓。
即便降袭，还需要参加宗学考试，考试分文、武、格物三途，可自选任意一途获得合格等次方能袭爵；连续两次不合格的，嫡长子也要降两等。
再次规定了宗禄的发放：郡王以上的，仍得宗禄，作为他们不能进入行政机构的补偿。其余宗室按级别得“宗室商社”股份，有爵位、分红，无宗禄。
条令另行规定，郡王以下宗室幼子，从出生到十五周岁，按级别不同得宗禄补贴——这一条是避免某一代败家宗室将股份交易出卖之后，其幼子衣食无着。凡仪宾（即宗室女婿），宗禄一律剥夺。
除了这些条款外，还有大量解禁条款：除宗室科举之禁，宗室参加科举得官的，不得袭郡王爵位，公爵以下随意；除宗室任官限制，宗室公爵以下，除不得入阁和入枢密院外，其余任命不受限制；除宗室“四民之业”禁令，凡宗室无论贵贱，都可在士、农、工、商等百业自食其力。