联军继续进攻北京，经巷战后攻陷北京。之后列强成立管理北京委员会对北京进行统治。
慈禧在出走时发布上谕，将战争的责任推到义和团头上，并命令各地清军予以剿杀。端王因为在义和团运动中是力主灭洋的头领，在八国联军的压力之下，被慈禧发配边陲，最后客死新疆。
义和团运动失败后,王五返回北京,本想出走塞上,再谋发展。可是许多北京的友人都来投奔大刀王五,把源顺镖局当做避难之所,外柜、内柜三十多间房住得满满的。这些人携老带幼,既不能随王五出走关外,又不能丢下不管。于是王五冒着风险留了下来。
因不满王五与义和团,清朝官兵围剿“源顺镖局”,王五的镖局中的武林豪杰由于寡不敌众,皆力战而死。
其实王五可以逃脱，当时八国联军和清政府都没抓住他，但他的镖局里去了一百多人避难。王五怕自己跑了以后，清政府或者八国联军把这一百多口男女老少扣为人质。他便把组织义和团、刀劈洋鬼子的事都担了下来，等着人来抓。清政府来抓他的时候，王五表示不反抗，但不要株连这一百多男女老少。当时捕头说：“够条汉子，你放心吧。”
王五曾刀杀德军司令，清廷决定把王五交给德军，在被押解到德军司令部的途中，大刀王五一路高呼着："大丈夫生不能报效正义，以死殉大业无憾！"在德军司令部，他受刑极惨，却毫不屈服。不久，被德军枪杀于前门东河沿。
清廷派人割下了大刀王五的人头，悬挂在京城城墙上，一代宗师，落得如此悲惨下场，人们无不扼腕叹息，却无人敢为英雄收尸。终于，几天之后，在一个黢黑的夜晚，一个身影蹿上了城墙，轻轻摘下大刀王五的人头，然后跳下城墙，消失在茫茫夜色中。
那人就是天津卫的大侠迷踪拳霍元甲。
原来，大刀王五在京遇难，被八国联军枭首示众，霍元甲听说后，便自天津只身赶来，他与刘振声潜入京城，盗回首级，并取得《老残游记》作者刘鹗协助，将义士身首合葬，尽了徒弟和朋友之义。
当天晚上，霍元甲就住在现在王五故居南房西侧的一间房子里。《老残游记》作者刘鹗与王五交厚，满怀悲愤写下了"爱国志士王五之墓"几个大字，以昭告天下。